
Pada prinsipnya Kegiatan belajar mengajar di MA Mambaul Ulum Bata-Bata bertumpu pada dua jurusan, Jurusan Ilmu Pengetahuan Sosial (IPS) dan Ilmu Pengetahuan Alam (IPA), dua jurusan yang juga diterapkan di beberapa madrasah atau sekolah lain, namun dalam hal pengembangan kompetensi siswa diluar dua disiplin ilmu tersebut, MA. Mambaul Ulum Bata-Bata juga melakukan pemetaan kelas (Mapping Class) dengan program unggulan di bidang Keagamaan (MA B), dan program kelas Billinggul (Bahasa Arab dan Bahasa Inggris), Program Jurusan IPA, dan IPS.
Kurikulum yang diterapkan, sama dengan lembaga pendidikan formal lainnya di PP. Mambaul Ulum Bata, yaitu perpaduan antara kurikulum pemerintah dan kurikulum pesantren, pada jurusan IPS selain para siswa dibekali dengan ilmu pngetahuan penunjang jurusan, juga terdapat mata pelajaran agama khas pesantren dengan kitab kuning sebagai sumber belajar, begitu juga
Jenjang pendidikan yang diselenggarakan di Pondok Pesantren Mambaul Ulum Bata-Bata dimulai dari jenjang paling bawah, yaitu Pendidikan Usia Anak Dini, keberadaan lembaga tersebut diharapakan akan dapat mencetak anak usia dini akan menjadi manusia yang cerdas, mandiri, beriman dan berakhlak Qur’ani serta siap lahir bathin untuk menempuh pendidikan dasar yang akan ditempuh selanjutnya, harapan tersebut dibuktikan dengan 


